אחת התלונות הקבועות כנגד אפל היא על הצנזורה שמתבצעת באפסטור, חנות האפליקציות לאייפון ולאייפוד טאץ' שלה. התקרית האחרונה אירעה בסוף השבוע, כאשר אפל סירבה לאשר אפליקציה של להקת Nine Inche Nails, משום שאחד השירים שמאפשרת האפליקציה להוריד מכיל, כפי שכינה זאת אחת העיתונים, "הטיה של הפועל Fuck". בעבר סירבה אפל לאשר אפליקציות שכללו ספרים שהכילו את המילה הזו, בטענה שהם מנוגדים לנוהלי השימוש של האפסטור. התוצאה היתה ביקורת נרחבת. כעת הודיעה אפל שמדיניות זו צפויה להשתנות.

ביוני צפויה אפל להשיק את האייפון 3.0, ובהודעה רשמית למחצה היא ציינה כי עם שחרור גרסת התוכנה החדשה שלו, יוכל המשתמש להחליט אם ברצונו לקבל גישה לתוכן למבוגרים. ההודעה נמסרה למגזין יפני, מקאיאמה, שאפליציית האייפון שלו נדחתה, משום שהציג תמונות של נשים בעירום חלקי. בהודעת הדחיה, ציינה אפל שרצוי שהעיתון יגיש שוב את האפליקציה שלו לאחר יציאת האייפון 3.0, משום שאז היא כנראה תאושר.